la structure primaire et secondaire des protéines

En ce moment je vais continuer notre chapitre concernant lesprotéines, précisément la structure primaire et secondaire, définitions et caractéristiques.

La structure primaire des protéines est formée d’un enchaînement des acides aminés liés les uns aux autres par des liaisons peptidiques dans un ordre précis.

La structure secondaire : c’est repliement local des acides aminés généralement en hélices alpha  et en  feuillets beta dont la propriété principale est de stabiliser la structure de la protéine par un caractère répétitif de liaisons hydrogènes intramoléculaire.

Hélices alpha 

Dans la structure d’hélice alpha qui présente bien dans les protéines fibreuses que dans les protéines globulaires, la chaîne des acides aminés prend la forme d'un tire-bouchon, Cette forme est le résultat de liaisons chimiques intramoléculaires.

Caractéristiques de l’hélice alpha :

-Hydrophiles, amphipathique ou encore hydrophobe selon la composition en acides aminés de    l'hélice.

-Constituée de 5 à plus de 40 acides aminés

-la structure est stabilisée par les liaisons hydrogène de l'atome d'oxygène.

-Les radicaux des résidus sont à l'extérieur de l'hélice.

-L’hélice ne peut s'établir qu'avec des résidus de la même série (L ou D)

-Les plans des liaisons peptidiques sont parallèles à l'axe de l'hélice et forment le squelette de  l'hélice.

-pas : 0,54 nm par tour.

NB : Alanine, Glutamine, Leucine et Méthionine sont  Les acides aminés qui favorise la formation d'hélice α sont, par contre Les acides aminés mauvais formateurs sont Proline, Glycine, Tyrosine et Serine.

Feuillets beta

Dans la structure de feuillet bêta, les liaisons peptidiques se répètent non plus sur une portion continue de la chaîne peptidique différente qui peut appartenir à la même chaîne ou à des chaînes différentes. L'ensemble forme comme une membrane plissée.

Caractéristiques de Feuillets beta

Les brins, au sein d'un feuillet, peuvent être parallèles ou antiparallèles.

Le type antiparallèle de feuillet est plus stable que le parallèle car les liaisons hydrogènes sont dans un alignement parfait

La Glycine, Valine et isoleucine sont présentent dans les feuillets β.

l'article suivante sera relatif au structure tertiaire et quaternaire des protéines.